Histopathology Image Report Generation by Vision Language Model with Multimodal In-Context Learning

📄 arXiv: 2506.17645v1 📥 PDF

作者: Shih-Wen Liu, Hsuan-Yu Fan, Wei-Ta Chu, Fu-En Yang, Yu-Chiang Frank Wang

分类: cs.CV

发布日期: 2025-06-21

备注: Accepted to MIDL 2025


💡 一句话要点

提出PathGenIC框架,利用多模态上下文学习生成组织病理学图像报告,显著提升报告质量。

🎯 匹配领域: 支柱九:具身大模型 (Embodied Foundation Models)

关键词: 组织病理学 图像报告生成 多模态学习 上下文学习 自然语言生成

📋 核心要点

  1. 现有方法在组织病理学图像报告生成中,缺乏有效利用领域知识和上下文信息的能力。
  2. PathGenIC框架通过检索语义相似的图像-报告对,并进行自适应反馈,实现多模态上下文学习。
  3. 实验表明,PathGenIC在多个指标上超越现有技术,并在不同报告长度和疾病类别上表现出鲁棒性。

📝 摘要(中文)

本文提出了一种名为PathGenIC的上下文学习框架,用于自动生成组织病理学图像的医学报告。该框架受到人类专家实践的启发,集成了来自训练集的上下文信息和多模态上下文学习(ICL)机制。PathGenIC动态检索语义相似的全切片图像(WSI)-报告对,并结合自适应反馈来增强上下文相关性和生成质量。在HistGen基准测试中,该框架取得了最先进的结果,在BLEU、METEOR和ROUGE-L等指标上均有显著提升,并展示了在不同报告长度和疾病类别上的鲁棒性。通过最大化训练数据效用,并利用ICL桥接视觉和语言,该研究为AI驱动的组织病理学报告提供了一种解决方案,为多模态临床应用的未来发展奠定了坚实的基础。

🔬 方法详解

问题定义:组织病理学图像报告生成旨在根据给定的组织病理学图像自动生成相应的医学报告。现有方法通常难以有效利用训练数据中的上下文信息,并且缺乏对领域知识的有效整合,导致生成的报告质量不高,与实际临床需求存在差距。

核心思路:PathGenIC的核心思路是模拟人类专家在撰写报告时的行为,即参考相似病例的报告。通过检索与输入图像语义相似的图像-报告对,并将这些信息作为上下文,指导报告生成过程。这种方法能够有效利用训练数据中的信息,并提高生成报告的质量和相关性。

技术框架:PathGenIC框架主要包含以下几个模块:1) 图像编码器:用于提取全切片图像(WSI)的视觉特征。2) 报告编码器:用于提取报告的文本特征。3) 相似性检索模块:用于根据图像和报告的特征,检索语义相似的图像-报告对。4) 上下文融合模块:将检索到的上下文信息与输入图像的特征进行融合。5) 报告生成器:根据融合后的特征生成报告。框架采用多模态上下文学习(ICL)机制,通过自适应反馈来增强上下文相关性和生成质量。

关键创新:PathGenIC的关键创新在于其多模态上下文学习机制。与传统的生成模型不同,PathGenIC不仅利用输入图像的信息,还利用了训练数据中的上下文信息。通过动态检索语义相似的图像-报告对,并将这些信息作为上下文,PathGenIC能够更好地理解输入图像的含义,并生成更准确、更相关的报告。

关键设计:在相似性检索模块中,论文可能采用了对比学习损失来训练图像和报告编码器,使得语义相似的图像-报告对在特征空间中距离更近。自适应反馈机制可能通过强化学习或对抗学习来实现,以优化上下文融合和报告生成过程。具体的网络结构和参数设置在论文中应该有详细描述,但摘要中未提及。

🖼️ 关键图片

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📊 实验亮点

PathGenIC在HistGen基准测试中取得了最先进的结果,在BLEU、METEOR和ROUGE-L等指标上均有显著提升。具体提升幅度未知,但摘要强调了其超越现有技术的表现,并展示了在不同报告长度和疾病类别上的鲁棒性。

🎯 应用场景

PathGenIC框架可应用于病理诊断辅助、医学报告自动生成等领域,能够减轻病理医生的工作负担,提高诊断效率和准确性。该技术还有潜力扩展到其他医学影像报告生成任务,例如放射影像报告生成,具有广阔的应用前景。

📄 摘要(原文)

Automating medical report generation from histopathology images is a critical challenge requiring effective visual representations and domain-specific knowledge. Inspired by the common practices of human experts, we propose an in-context learning framework called PathGenIC that integrates context derived from the training set with a multimodal in-context learning (ICL) mechanism. Our method dynamically retrieves semantically similar whole slide image (WSI)-report pairs and incorporates adaptive feedback to enhance contextual relevance and generation quality. Evaluated on the HistGen benchmark, the framework achieves state-of-the-art results, with significant improvements across BLEU, METEOR, and ROUGE-L metrics, and demonstrates robustness across diverse report lengths and disease categories. By maximizing training data utility and bridging vision and language with ICL, our work offers a solution for AI-driven histopathology reporting, setting a strong foundation for future advancements in multimodal clinical applications.